Thursday, April 7, 2016

19 Retrovirus Kuno Ditemukan Tidur di Dalam Genom Manusia

Penelitian ~ Retrovirus kuno ditemukan dalam DNA Manusia dan masih aktif. Sisa-sisa peristiwa kuno sejak terkubur di tubuh para leluhur mengintai beberapa orang yang hidup hari ini.

Meskipun pada tingkat rendah, bukti mencolok virus kuno yang sebelumnya hanya dikenal dari bukti fosil terus menerus menginfeksi manusia ratusan ribu bahkan jutaan tahun.

Belasan potongan baru DNA non-manusia ditinggalkan virus yang pertama menginfeksi nenek moyang ratusan ribu hingga jutaan tahun lalu tetap mengintai dalam genom manusia dan sewaktu-waktu mengumpulkan peralatan menjadi agen epidemi baru.

Paling tidak 19 jenis fosil hidup retrovirus kuno dengan salinan utuh di dalam genom manusia memunculkan pertanyaan misterius bagaimana para siluman selamat dan menyarankan masa lalu evolusioner jauh ketika tertidur dalam DNA banyak spesies.

Retrovirus dengan salinan berulang ke dalam genom dari sel yang terinfeksi kadang-kadang menginfeksi garis sel garis kuman yang ditemukan dalam telur dan sperma bertahan membuat organisme baru berisi retrovirus sebagai bagian inheren dari genom.

Seiring waktu copy-paste genom banyak mamalia, burung dan vertebrata lainnya mengumpulkan banyak urutan DNA retrovirus yang dikenal sebagai Endogenous Retroviruses (ERVs) dan sekitar 8% genom manusia terdiri dari Human Endogenous Retrovirus (HERVs).

Meskipun sebagian besar urutan adalah fosil genomik dan mampu menghasilkan partikel menular, beberapa ERVs dikooptasi untuk melakukan fungsi fisiologis dalam organisme host dalam memberikan kekebalan. Urutan ERVs ini biasanya telah jinak setelah kehilangan peralatan genetik.

Tapi para ilmuwan pekan lalu melaporkan ada sebagian kecil urutan ERVs yang dapat membuat partikel menular. Proses yang kurang dipahami menunjuk siluman hampir tidak bisa dipercaya sepenuhnya karena dapat mengumpulkan peralatan genetik baru dan bangkit kembali.

"Kami memberi informasi penting yang diperlukan untuk memahami bagaimana retrovirus dan manusia berevolusi bersama-sama dalam waktu relatif baru," kata John Coffin, virolog Tufts University School of Medicine di Boston.

Banyak materi virus sangat kuno, sementara ERVs lebih baru lebih utuh dan minim terdegradasi mutasi. Pada beberapa spesies seperti tikus, genom mengandung banyak ERVs yang mampu menghasilkan virus menular. Pada manusia, HERV-K berpotensi mampu replikasi meskipun jutaan tahun.

Banyak pertanyaan tetap di papan tulis. Apakah HERV-K benar-benar masih aktif pada manusia? Apakah terbengkalai dan siap kembali tampil sebagai agen epidemi menular? Atau tanda-tanda aktivitas HERV-K baru-baru ini benar-benar hanya pergolakan kematian?

"Banyak penelitian telah mencoba menghubungkan elemen virus endogen dengan kanker dan lainnya, tetapi kesulitan utama bahwa kita belum benar-benar menemukan semua," kata Zachary H. Williams, virolog Tufts University School of Medicine di Boston.

Jurnal : Julia Halo Wildschutte et al. Discovery of unfixed endogenous retrovirus insertions in diverse human populations, Proceedings of the National Academy of Sciences, March 21, 2016, DOI:10.1073/pnas.1602336113
Tinuku
Bagikan :

No comments:

Post a Comment