Monday, December 23, 2013

Sekuen Genom Amborella trichopoda Leluhur Bunga

www.LaporanPenelitian.com - Satu-satunya bunga kuno yang selamat rakus gen, semak langka Amborella trichopoda seluruhnya mengkonsumsi genom spesies lain. Klan tanaman semak berbunga paling kuno yang hidup hari ini mencuri dan menimbun gen spesies lain pada skala rakus.

Sekuen genom Amborella trichopoda mengisyaratkan adaptasi genetik yang membantu bunga muncul dan menaklukkan dunia 160 juta tahun lalu ketika ledakan evolusioner yang dibayangan Charles Darwin sebagai "abominable mystery".

Tim botani internasional membangun kasus lebih dari satu dekade Amborella trichopoda, satu-satunya yang selamat dari garis keturunan di bagian paling dasar silsilah hidup tanaman berbunga. Tanaman aneh menangkap bukan hanya potongan, tapi seluruh genom 3 jenis alga dan lumut.

"Genom 2 kali lipat mungkin memberi penjelasan proliferasi mendadak spesies baru tanaman berbunga dalam catatan fosil dating Cretaceous. Para ilmuwan telah lama bekerja untuk memecahkan teka-teki ini," kata Claude dePamphilis, biolog Penn State University.

Tumbuh native di 18 titik di pulau New Caledonian dari Grande Terre di Pasifik Selatan hingga tempat lain di Bumi. Struktur reproduksi tanaman terbungkus dalam tepal yaitu hibrida antara kelopak dan struktur pendukung seperti daun disebut sepal.

Sama seperti genom platypus ketika munculnya mamalia, Amborella memberi sekilas perubahan yang membantu angiosperma diversifikasi dari satu leluhur dengan gymnosperma yaitu keturunan tanaman besar lain meliputi pohon konifer seperti cemara.

Nenek moyang awal tanaman berbunga memperoleh salinan duplikat genom yang dikenal sebagai poliploidi. Banyak angiosperma diketahui polyploid seperti kentang yang memiliki 2 hingga 6 salinan dari setiap kromosom. Tapi duplikasi di Amborella mendahului semua polyploids lain.

Gen ini tidak berada dalam sel nucleus, tetapi dalam genom terpisah dari mitokondria, pembangkit energi kecil dari sel. Duplikasi memacu diversifikasi dan perluasan tanaman berbunga dengan menyediakan salinan tambahan dari masing-masing gen secara evolusioner untuk fungsi baru.
Amborella Genome Project. The Amborella Genome and the Evolution of Flowering Plants. Science, 20 December 2013: Vol.342 no.6165, DOI:10.1126/science.1241089

Danny W. Rice (Department of Biology, Indiana University, Bloomington, IN 47405, USA) et al. Horizontal Transfer of Entire Genomes via Mitochondrial Fusion in the Angiosperm Amborella. Science, 20 December 2013: Vol.342 no.6165 pp.1468-1473, DOI:10.1126/science.1246275

Srikar Chamala (Department of Biology, University of Florida, Gainesville, FL 32611, USA) et al. Assembly and Validation of the Genome of the Nonmodel Basal Angiosperm Amborella. Science, 20 December 2013:
Vol.342 no.6165 pp.1516-1517, DOI:10.1126/science.1241130
Gambar: Sangtae Kim
Tinuku
Bagikan :

No comments:

Post a Comment