Skip to main content

Virus Herpes Simplex Tipe 1 Out of Africa

Laporan Penelitian - Gen virus Herpes mendukung teori migrasi Out of Africa. Sekuen genom 31 strain Virus Herpes di Afrika, Eropa, Asia dan Amerika Utara mendukung teori migrasi kuno.

"Strain virus yang Anda prediksi berdasarkan sekuen genom manusia. Kami menemukan semua isolat cluster bersama Afrika. Semua virus dari Timur Tengah, Korea, Jepang, China, Eropa dan Amerika," kata Curtis Brandt, mikrobiolog University of Wisconsin-Madison.

"Kami temukan persis seperti antropolog katakan kepada kita dan ahli genetika molekuler yang telah menganalisis genom manusia tentang di mana manusia berasal dan bagaimana mereka menyebar di seluruh planet," kata Brandt.

Nenek moyang manusia muncul di Afrika sekitar 150.000 sampai 200.000 tahun lalu kemudian menyebar ke arah timur menuju Asia dan barat menuju Eropa. Para ilmuwan sebelumnya menyelidiki Herpes Simplex Virus Tipe 1 (HSV-1) dengan melihat satu atau sekelompok kecil gen, namun pendekatan ini bisa menyesatkan.

Brandt dan rekan menggunakan sekuen genetik berkapasitas tinggi dan bioinformatika lebih canggih untuk menganalisis sejumlah besar data dari genom 31 strain HSV-1. Masing-masing pohon keluarga digabungkan ke dalam satu jaringan pohon seluruh genom.

"Sampel di Texas datang dari seseorang yang melakukan perjalanan dari Timur Jauh atau berasal dari Amerika asli yang nenek moyangnya menyeberangi Selat Bering sekitar 15.000 tahun lalu," kata Aaron Kolb, optalmolog University of Wisconsin-Madison.

HSV-1 jadi virus ideal karena mudah dikumpulkan, tidak mematikan dan mampu membentuk infeksi laten seumur hidup. Virus menyebar melalui kontak dekat sehingga cenderung berjalan dalam keluarga. Selain itu HSV-1 jauh lebih sederhana dibanding genom manusia yang memotong biaya sekuensing.
Using HSV-1 Genome Phylogenetics to Track Past Human Migrations

Aaron W. Kolb1 et al.
  1. Department of Ophthalmology and Visual Sciences, School of Medicine and Public Health, University of Wisconsin-Madison, Madison, Wisconsin, United States of America
PLoS ONE, October 16, 2013

Akses : DOI:10.1371/journal.pone.0076267

Gambar: Aaron W. Kolb et al., DOI:10.1371/journal.pone.0076267

Comments

Popular

Agama Mendidik Anak-Anak Menjadi Serakah

Penelitian ~ Agama membuat anak-anak tidak bermurah hati. Keyakinan agama memiliki pengaruh negatif pada altruisme dan kepekaan sosial atau daya empati.

Tungau Wajah Demodex folliculorum dan Demodex brevis

www.LaporanPenelitian.com - Tungau kecil merayap di seluruh wajah Anda, tes DNA mengungkap kemahahadiran 2 spesies arakhnida hidup di kulit manusia. Demodex folliculorum dan Demodex brevis adalah teman dunia luar Anda paling intim.

Pemburu-Pengumpul Zaman Batu Mengobati Sakit Gigi Pakai Alat Batu dan Aspal

Penelitian ~ Pemburu-pengumpul Zaman Batu mengobati sakit gigi menggunakan alat tajam dan tar. Dokter gigi tidak mengebor dan menambal, tapi menggores dan melapisi. Temuan gigi menambah bukti bahwa beberapa bentuk kedokteran gigi telah muncul selama setidaknya 14.000 tahun lalu.

Dua gigi dari orang yang tinggal di Italia utara 13.000 hingga 12.740 tahun lalu menanggung tanda-tanda seseorang telah menghapus infeksi jaringan lunak bagian dalam. Daerah yang diolah kemudian ditutup dengan zat lengket seperti tar menggunakan alat batu, para ilmuwan melaporkan ke American Journal of Physical Anthropology.

Temuan menunjukkan bahwa teknik untuk menghapus bagian-bagian gigi yang terinfeksi gigi telah dikembangkan ribuan tahun sebelum fajar pertanian yang kaya diet karbohidrat sebagai penyebab utama merebaknya gigi berlubang. Petani mungkin sudah terbiasa menggunakan alat-alat batu untuk mengebor gigi berlubang sejak 9.000 tahun lalu.

Stefano Benazzi, antropolog University of Bologna, pada tah…