Thursday, October 31, 2013

Sekuen Genom Buah Kiwi Actinidia chinensis

Laporan Penelitian - Draft sekuen genom Buah Kiwi Actinidia chinensis sudah terbit. Tim Amerika Serikat dan China telah selesai sekuensing genom segar buah Kiwi.

Actinidia chinensis adalah berry silinder berbentuk bulat telur dengan kulit coklat kemerahan ditutupi rambut pendek. Buah Kiwi berasal dari China barat daya dan tidak populer sampai awal abad ke-20 ketika petani di Selandia Baru membudidaya komersial.

Untuk urutan genom, tim menggunakan varietas China disebut Hongyang kemudian membandingkan ke genom spesies tanaman perwakilan lainnya termasuk tomat, padi, anggur dan mustard gulma Arabidopsis. Identifikasi sekitar 8.000 gen umum di antara semua spesies.

Data juga mengungkap 2 mutasi tidak biasa yang terlibat dalam proses pembelahan sel terjadi sekitar 27 hingga 80 juta tahun lalu ketika ekspansi luas gen muncul dari salinan ekstra seluruh genom, diikuti dengan hilangnya gen yang lain.

Ketika gen diduplikasi, gen tambahan bermutasi untuk melakukan fungsi yang sama sekali baru. Proses ini disebut neofunctionalization yang dapat terjadi tanpa efek samping pada tanaman dan dalam kasus buah kiwi cukup menguntungkan.

"Duplikasi berkontribusi menambah gen tambahan anggota keluarga yang terlibat dalam karakteristik penting Kiwi seperti vitamin C, metabolisme flavonoid dan karotenoid," kata Zhangjun Fei, biolog Cornell University.
Draft genome of the kiwifruit Actinidia chinensis

Shengxiong Huang1 et al.
  1. School of Biotechnology and Food Engineering, Hefei University of Technology, Hefei 230009, China
  2. Ministry of Education Key Laboratory for Bio-resource and Eco-environment, College of Life Science, State Key Laboratory of Hydraulics and Mountain River Engineering, Sichuan University, Chengdu 610064, China
Nature Communications, 18 October 2013

Akses : DOI:10.1038/ncomms3640
Tinuku
Bagikan :

No comments:

Post a Comment